วัดได้เริ่มก่อสร้างเมื่อปี พ.ศ.2498 โดยพระอธิการบุญมา ปญฺญาปโชโต ผู้บริจาคที่ดินคือจ่าสิบเอกคำ ศิลากุล และนายพูน มณีวรรณ พระภิกษุสามเณรละพุทธศาสนิกชนได้ร่วมแรงร่วมใจกันพัฒนาวัดให้เป็นแหล่งปฏิบัติวิปัสสนากรรมฐานและเจริญศีลภาวนา โดยมีหลวงพ่อเที่ยง ปภังกโร ศิษย์เอกของเจ้าอธิการบุญมา ผู้เจริญรอยตามในธรรมปฏิบัติและวิทยาคมของเจ้าอธิการบุญมา เป็นเจ้าอาวาสวัดพระพุทธบาทเขากระโดงองค์ปัจจุบัน ภายในบริเวณวัดเป็นที่ตั้งของพระสยามเทวเจดีย์ ซึ่งเป็นเครื่องเตือนให้ระลึกถึงพระมหากรุณาธิคุณของกษัตริย์ทั้ง 5 พระองค์ ผู้ประกาศอิสรภาพภายนอกพระสยามเทวเจดีย์ ที่บริเวณซุ้มประตูทางเข้าองค์พระเจดีย์ มีพระบรมรูปทรงม้าอยู่ทั้ง 4 ทิศ ส่วนภายในมีบันทึกเล่าถึงประวัติของปูชนีย์วัตถุ ข้อความซึ่งกล่าวถึงพิชัยสงคราม ไว้โดยรอบผนังพระเจดีย์